聖闘士星矢の物語が始まる！！ 「聖闘士星矢」の物語はギリシアの聖域で修行をする一人の少年、星矢から始まる。青銅聖闘士になるため、宿敵「カシオス」と青銅聖衣を賭けてバトルする！この戦いの中で身体の中に小宇宙を燃やすことに成功した星矢は見事戦いに勝ち、青銅聖衣を勝ち取ることに成功したが、日本人の星矢に聖衣を渡したくないシャイナが現れ…！？

エリシオンにおける星矢と冥王ハーデスの激闘より遡ること二百四十数年前…。熱き友情で結ばれた二人の少年の絆を引き裂き、もう一つの聖戦が始まろうとしていた!! 過去と現在が交錯する新たなる銀河神話、「聖闘士星矢」の正統なる続編が始動!!

戴冠！！海皇ポセイドン！の巻 教皇のサガの奇行を止めた後、世界には再び平和が戻っていた。城戸沙織はジュリアン家のパーティーに招待され、頭領のソロと出会う。しかし、ソロは実は海皇ポセイドンの化身であった！新たにアテナを狙う海闘士達に星矢が立ち向かう！物語は新たなる章へ突入する！

目覚めよ！！エイトセンシズの巻 何故かアテナは自らの喉い短剣を突き刺し、死んでしまった！しかし、寝返ったと思われていたシオンの目的は、星矢達をエイトセンシズに目覚めさせ冥界へいかせ真のアテナの考えを星矢達に託すことだったのだ！星矢達は死んでいった仲間の想いを胸に、冥界へ行くのだった！

教皇の間の死闘！の巻 黄金聖闘士随一の美貌を誇る魚座のアフロディーテとアンドレメダ瞬との死闘が白熱する最中、ついに星矢は教皇の間に辿り着く！しかしそこに待っていたのは過去に行方不明になっていた双子座の聖闘士だった…！その目的と理由とは…！？

少年たちよ！女神を託すの巻 かつての師カミュによって氷づけにされた氷河を助け出した星矢達、その先に待ち受けるのは蠍座のミロ！強敵に立ち向かうミロの考えとは⁉そして、ついに十二宮に十二の黄金聖衣が揃う！今は無人の人馬宮にアイオロスが未来へと残したメッセージとは…！？

フェニックス！地獄よりの戦士の巻 黄金聖衣をバラバラにし、暗黒聖闘士と青銅聖闘士最強ともいわれる鳳凰の聖衣を持つフェニックス一輝が奪い去ってしまった！ペガサスの星矢、ドラゴン紫龍、キグナス氷河、アンドロメダ瞬は黄金聖衣奪還のために暗黒聖闘士が潜む拠点に忍び込むが…！？

復活！ハーデス百八の魔星の巻 海皇ポセイドンの脅威から数日がたち、五老星から封印の塔を監視し続けてきた天秤座の童虎がハーデスの復活を感知した…すでに、聖域には冥闘士となって甦ったデスマスクとアフロディーテ、そして味方であるはずのサガ、シュラ、カミュまでもが敵側に寝返り…！？

響け！女神の祈りの巻 神であるポセイドンに勝てることができないと思った瞬間、射手座の黄金聖衣が星矢に装着され、勝機が見えてきていた！目指すはアテナがとらわれているメインブレドウィナ！紫龍や氷河にも黄金聖衣が次々と装着されさらに有利になるが、海皇ポセイドンの恐ろしさはまだまだ続く…！

海底神殿！七本の柱の巻 海闘士によってアテナは海底にあるポセイドン神殿までさらわれてしまった！アテナの命が尽きたころには世界が海によって沈没してしまう！阻止するべく、星矢達はポセイドン神殿にある七本の柱を破壊しに行くが、そこには強敵、海闘士達が一人ずつ存在していた！